Prototype - Misión 5: Cruzando la T

Esta es la sucesión de la misión 4, tras ver caer por la ventana a Alex vemos como extrañas criaturas clonadas caen también y deboran al personal militar. Alex agarrará a un soldado, consumiendole y obteniendo información confidencial que le indica que existe una base secreta en una factoria que le permitirá eliminar a las criaturas. En esta misión se desbloquean las infiltraciones (tras esta misión compra la habilidad consumo sigiloso).

-Ve a la fábrica
Ve a la fábrica, pero no te preocupes por los soldados, estarán peleados con los monstruos, que te seguirán. Cuando llegues a la azotea de la fábrica empezará una escena en que caes dentro de la base. Elimina a los soldados y utiliza armas de fuego para eliminarles.

-Sobrevive a los cazadores
A las criaturas se les pone el nombre de "Cazadores" y aparecen para eliminar a Alex. Cada vez que elimines a uno, aparecerán mas todavia para reemplazarle. Cuando el primero de todos esté herido debemos consumile para adquirir la habilidad de garra. Estas garras recuerdan a Lobezno de los comics de Marvel, Xmen. Utilizalo y esquiva a los enemigos para eliminarlos.

-Destruye los contenedores
Cuando empiecen a llegar mas, Alex optará por eliminarles de otra manera. Ahora debemos destruir los contenedores para crear una explosión que mate a los cazadores. Utiliza las armas de fuego y las patadas aereas para quitarles mas salud y destruirlas antes. Tras esto aparecerá una explosión y el edificio se derrumbará. Aparece Alex entre los escombros vivo con el subtitulo de "Misión Cumplida".